1.职工食堂在农贸市场购买的米面、蔬菜等无法取得发票，除非当地税务机关有口径，可以凭购买物品清单和收据作为税前扣除凭证在税前列支，否则都不能税前扣除。
如从个人购买初级农产品（青菜等），可以采用去税务机关代开发票处理，一般情况下代开发票过程不需要缴纳任何税费（仅是从农业生产者个人手上购买初级农产品）。
2.职工食堂对外招待客户，在职工食堂用餐，这种情况下企业应当单独核算该部分支出，该支出应当计入业务招待费，按照业务招待费税前扣除标准处理。
3.不考虑食堂对外经营等其他情况，职工食堂支出直接原材料、人工、资产折旧等转入职工福利费、业务招待费，且取得进项税额不能抵扣。
4.内部食堂核算，单位内设职工食堂属于不需要办理税务登记的内设机构，虽然单独设置了账簿，但不属于独立的增值税纳税义务人，公司向内部食堂拨付的福利费或者补贴款，不需要取得发票，凭收据列支，但是食堂购买加工餐费原料未取得相关发票，也不得在企业所得税前申报扣除。
5.企业将食堂直接承包给个人，如个人没营业执照，无法提供正规的票据。这种情形属于以企业的名义对内经营，所以营业部分不缴纳增值税。处理方法可以同上面第一种的内部核算方式处理，需要取得合法的采购票据。另，个人应当按照承包承租经营所得缴纳个人所得税。
6.企业与个体工商户或其他企业签订协议，直接承包给个体工商户或其他企业。食堂除为本单位员工提供餐饮服务，还同时为本单位以外的其他单位或个人提供餐饮服务，企业凭个体工商户开具的餐饮发票作为福利费税前扣除。
7.职工食堂实行的是免费用餐制度涉及到个税问题。
国家税务总局2012年4月11日9:30，“所得税司巡视员卢云”关于“所得税相关政策交流”在线交流，其中提到：[所得税司巡视员卢云]根据个人所得税法的规定原则，对于发给个人的福利，不论是现金还是实物，均应缴纳个人所得税。但目前我们对于集体享受的、不可分割的、非现金方式的福利，原则上不征收个人所得税。[2012-04-11 10:18:45]
如果能明确职工个人“吃了多少”就要合并工资薪金缴纳个税，比如给饭卡里每一个月冲300元、每一餐给30元餐券；如果无法核算每一个人“吃了多少”就不需要合并工资薪金缴纳个税，比如：拿着单位员工卡就可以进食堂吃饭，所谓的“刷脸”吃饭。
8.食堂额外为单位员工提供收费餐饮服务或者食品（比如食堂自己生产、加工过程的食品，下同），属于财税（2016）36号文件“单位或者个体工商户为聘用的员工提供服务”非经营活动，不征收增值税；但是为外单位提供收费餐饮服务或者食品，需要按照餐饮服务缴纳增值税。
9.一般纳税人将不动产用于食堂，如该项不动产（以房产证为准或会计核算为判断依据）除了用于食堂，同时还用于其他生产经营活动等可以抵扣进项税额，或者食堂有对外餐饮服务（6%）的收入，该项不动产的进项税额可以全额抵扣进项税额。
10.一般纳税人的食堂有对外餐饮服务（6%）的收入，食堂中的固定资产（如馒头机），无法划分除用途和专门用于对外餐饮服务（6%）的，都可以全额抵扣进项税额。
