答：（1）在生产企业出口退税申报系统录入退运（未退税）证明的流程：
第一步：进入向导→申报系统操作向导→单证向导；
第二步：二单证明细数据采集→退运已补税（未退税）证明申请→设置标志；
第三步：三打印单证申请表→打印单证申报报表→选择退运已补税（未退税）证明申请表；
第四步：四生成单证申报数据→生成单证申报数据。
注意：如果已进行免抵退税正式申报的，须在生产企业出口退税申报系统中红字冲减该退运的免抵退税销售额。
（2） 出口企业到主管税务机关申请办理退运（未退税）证明，需提供电子数据及下列资料：①出口货物报关单（退运发生时已申报退税的，不需提供）；②出口发票；③主管税务机关要求报送的其他资料。
