财政部即将发布企业免税所得工本费用与损失的分摊办法，包含证券商、期货商与房地产业者，从今年开端，将拥有较具弹性与合理的免税所得工本、费用的减税权，节税空间变大。
因应去（95）年5月30日修正公布的所得税法第24条第1项规定，财政部已经拟订「营利事业免税所得相关工本费用损失分摊办法」，并明令要从96年度营利事业所得税开端适用，企业在97年5月办理96年度营所税申报时，即应按照新办法归类并摊计免税与应税所得的工本、费用。
财政部表示，企业从事土地、证券与期货等交易所得，享有免税或暂停课税的优惠，另外还有部分勿需计入所得额课税的股利或盈余净额，促使企业的所得产生应税与免税收入等两大区块。因此在应税与免税所得项下的各项工本费用，一旦无法明确归属是应税或免税部门下产生者，就要依据财政部订定的分摊办法进行比率分摊，不能全数行计。
过去，财政部未准许业者自行依据应税部门或免税部门选择分摊方式。新办法公布后，因目的事业主管机关规范而分设部门营运且作部门别损益计算者，可以自行选择按营业费用性质在部门间选定适当基准分摊费用，但一经选定后，即不得再更改。
这项准许自行按部门别选择分摊计算方式的规定，对综合证券商最为有利。
财政部举例，综合证券商年营收属于免税所得100万元、应税所得也是100万元，综合证券商分为证券、自营与承销三大部门，免税所得100万元若均发生在证券部门，过去不得自行选择按部门别分摊时，假设无法归属的费用为100万元，应税与免税所得需各按二分之一、即50万元，摊行费用。
新规定按部门别分摊费用后，证券、自营与承销三大部门，按部门别后即可平均按三分之一摊行，免税部门可摊行的费用降为33.3万元，应税所得即可以分摊较多的费用，所得税自然会下降。
新免税所得费用分摊办法亦准许证券商、期货商与房地产等业者持有未出售的有价证券、期货或土地，在出售当年度，证券、期货与土地在持有期间，经运用后产生的应税及免税收入，亦可合并分摊免税费用。
这项规定对房地产业者也分有利。财政部举例，假设甲公司在96年1月购入一块土地，同年12月出售，未出售前11个月土地有租金收入，过去土地租金不能分摊购地的利息支出费用，新办法则同意可按比率减除。
