二、关税政策文件
1、《海关总署关于对部分矿产品的进口环节增值税税率调整的公告》（海关总署2008年第95号公告）规定，自2009年1月1日起，对盐、煤泥等82种矿产品的进口环节增值税税率由13%提高到17%。
2、《财政部关于恢复征收硫磺进口环节增值税的通知》（财关税[2009]35号）和《海关总署关于恢复征收硫磺（税号：25030000、28020000）的进口环节增值税的公告》（海关总署2009年第28号公告）规定，自2009年6月1日起，恢复征收硫磺（税号：25030000、28020000）的进口环节增值税，税率为17%。
三、税收管理文件
1、《国家税务总局关于调整增值税一般纳税人纳税申报“一窗式”管理操作规程有关事项的通知》（国税函[2008]1074号）规定，《增值税一般纳税人纳税申报“一窗式”管理操作规程》（国税发[2005]61号印发）规定的《废旧物资发票开具清单》、《代开发票抵扣清单》、《废旧物资发票抵扣清单》（自2009年5月1日起）停止报送；用防伪税控报税系统和机动车销售统一发票税控系统采集的专用发票、机动车销售统一发票金额、税额汇总数分别与《增值税纳税申报表附列资料（表一）》、《增值税纳税申报表附列资料（表二）》中相关数据必须相符，同时增加和取消了比对和报表的内容。
2、《国家税务总局关于调整增值税纳税申报有关事项的通知》（国税函[2008]1075号）对《增值税一般纳税人纳税申报办法》（国税发[2003]53号）印发的《增值税纳税申报表（适用于增值税一般纳税人）》（含附列资料）以及《国家税务总局关于做好增值税普通发票一窗式票表比对准备工作的通知》（国税发[2005]141号）所附《增值税纳税申报表（适用于小规模纳税人）》的格式、填报内容及说明进行了修订，使之适用于转型后的增值税政策与管理，并规定“纳税人应按月进行纳税申报，申报期为次月1日起至15日止，遇最后一日为法定节假日的，顺延1日；在每月1日至15日内有连续3日以上法定休假日的，按休假日天数顺延。”
3、《国家税务总局关于增值税一般纳税人认定有关问题的通知》（国税函[2008]1079号）规定，在国家税务总局新《增值税一般纳税人认定管理办法》颁布前，原增值税一般纳税人认定的有关规定仍继续执行，即：2008年应税销售额超过新标准的小规模纳税人向主管税务机关申请一般纳税人资格认定的，主管税务机关应按照原规定为其办理一般纳税人认定手续。年应税销售额未超过新标准的小规模纳税人，也可以按照原规定向主管税务机关申请一般纳税人资格认定。2009年应税销售额超过新标准的小规模纳税人，应当按照《中华人民共和国增值税暂行条例》及其实施细则的有关规定向主管税务机关申请一般纳税人资格认定。未申请办理一般纳税人认定手续的，应按销售额依照增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项税额，也不得使用增值税专用发票。
4、《国家税务总局关于废旧物资发票抵扣增值税有关事项的公告》（国家税务总局2008年第1号公告）规定，自2009年1月1日起，从事废旧物资回收经营业务的增值税一般纳税人销售废旧物资，不得开具印有“废旧物资”字样的增值税专用发票（以下简称废旧物资专用发票）；一般纳税人取得的2009年1月1日以后开具的废旧物资专用发票，不得再作为增值税扣税凭证，在2009年1月1日以后取得的2008年12月31日以前开具的废旧物资专用发票，应当在开具之日起90天内办理认证，并在认证通过的当月核算申报抵扣。自2009年4月1日起，一般纳税人取得的废旧物资专用发票一律不得作为增值税扣税凭证计算抵扣进项税额。
5、《国家税务总局关于部分地区试行海关进口增值税专用缴款书“先比对后抵扣”管理办法的通知》（国税函[2009]83号）规定，从2009年4月1日起河北、河南、广东、深圳四省市海关进口增值税专用缴款书（以下简称海关缴款书）试行“先比对后抵扣”办法，届时增值税一般纳税人（以下简称纳税人）进口货物取得属于增值税扣税范围的海关缴款书，应当在开具之日起90天内向主管税务机关报送《海关完税凭证抵扣清单》（包括纸质资料和电子数据）申请稽核比对，逾期未申请的不予抵扣进项税额。对于已申请稽核但尚未取得稽核相符结果的海关缴款书进项税额，纳税人应在“应交税金”科目下设“待抵扣进项税额”明细科目进行核算。
6、《国家税务总局关于增值税小规模纳税人出口货物免税核销申报有关问题的通知》（国税函[2009]108号）规定，从2009年4月1日起，纳税期限为一个月的增值税小规模纳税人出口货物的免税申报期限，仍按国税发[2007]123号文件有关规定执行；纳税期限为一个季度的增值税小规模纳税人，应在办理纳税申报后的下个季度的纳税申报期内，向主管税务机关申请办理出口货物免税核销手续，无法在规定期限办理的，可在申报期限内向主管税务机关提出有合理理由的免税核销延期申报书面申请，经核准后，可延期一个季度办理免税核销申报手续。
7、《国家税务总局关于增值税简易征收政策有关管理问题的通知》（国税函[2009]90号）规定，①一般纳税人销售自己使用过符合财税[2008]170号和财税[2009]9号文件等规定的固定资产，按简易办法依4%征收率减半征收增值税政策的，并不得开具增值税专用发票。小规模纳税人销售自己使用过的固定资产，也不得由税务机关代开增值税专用发票。②纳税人销售旧货，应开具普通发票，不得自行开具或者由税务机关代开增值税专用发票。③一般纳税人销售适用财税[2009]9号文件第二条第（三）项、第（四）项和第三条规定的货物，可自行开具增值税专用发票。同时明确：小规模纳税人销售自己使用过的固定资产和旧货的销售额和应纳税额计算公式为：销售额=含税销售额/（1+3%）；应纳税额=销售额×2%。
8、《财政部国家税务总局关于印发〈油气田企业增值税管理办法〉的通知》（财税[2009]8号）印发了《油气田企业增值税管理办法》和与之有关的《增值税生产性劳务征收范围注释》，规定自2009年1月1日起执行。油气田企业应注意上述《办法》和《注释》中与己有关的具体规定，届时（94）财税字第073号、财税字[2000]32号和国税发[2000]195号三个原与之有关的文件相继废止。
9、《财政部关于明确办理再生资源增值税退税程序的补充通知》（财监字[2009]7号）规定，市、区、州财政局负责初审，实行"省直管县"财政管理体制的，县（县级市、区、旗）财政局负责初审；省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅（局）负责复审；专员办负责终审，并按规定办理退税手续。
10、《国家税务总局货物与劳务税司关于卷烟消费税最低计税价格调整后卷烟工业企业与卷烟批发企业差价结算开具增值税专用发票有关问题的通知》（货便函[2009]95号）规定，根据重新核定的各牌号、规格卷烟消费税最低计税价格，卷烟工业企业和卷烟批发企业之间应对2009年5月份的购销情况进行汇总计算。对于汇总计算后卷烟工业企业应向卷烟批发企业补收价款的，卷烟工业企业可按补收价款的数额向卷烟批发企业汇总开具蓝字增值税专用发票；对于汇总计算后卷烟工业企业应向卷烟批发企业退还价款的，可由卷烟批发企业依据退还价款的数额向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》，在《开具红字增值税专用发票申请单》上选择“购买方申请\已抵扣”栏次，主管税务机关出具《开具红字增值税专用发票通知单》，在《开具红字增值税专用发票通知单》上选择“购买方申请\需要作进项税额转出”栏次，卷烟工业企业依据《开具红字增值税专用发票通知单》开具红字增值税专用发票。
11、《国家税务总局关于外商投资企业采购国产设备增值税专用发票遗失问题的批复》（国税函[2008]1078号）规定，玖龙纸业（重庆）有限公司遗失的53份（增值税专用发票抵扣联，增值税税款4951824.02元）购进国产设备的增值税专用发票确定已经防伪税控系统认证通过，且已通过出口退税电子数据传输系统取得增值税专用发票稽核信息的实际情况，可比照《国家税务总局关于修订〈增值税专用发票使用规定〉的通知》（国税发[2006]156号）有关规定，使用增值税专用发票联复印件办理退税手续。
