大姚县遵循“精简、统一、规范、高效”的原则，建立和完善财政专户各项管理制度，实现财政资金集中管理、统一调度和分账核算，形成了分配、监督与核算相分离的管理运行机制。
一是建立财政专户资金管理制度。制定了《大姚县财政局财政资金专户管理办法》，对财政专户开设、变更、撤销以及财政内部股室职责作出详细规定，明确财政资金分配、监督、债权债务处置由业务主管股室负责，银行账户开设、资金拨付由国库股负责。印制了《大姚县财政局财政专户资金拨款通知单》作为财政专户资金拨款凭据，规范了财政专户资金拨付。
二是建立资金拨付审批制度。加强对用款单位用款申请的审核，严格坚持按预算、按进度拨款，严禁超指标拨款。实行财政专户资金拨付审批管理，明确业务股室、分管领导、局长的拨款审核审批权限。
三是建立印鉴管理制度。规范了拨款印鉴的预留、保管和使用，严格分人分印管理，财政局长印鉴统一由局监督检查股设专人保管，实行用印审批登记制度。县、乡两级所有拨款印鉴都有专用保险柜保管，做到入柜上锁，使用时不脱离保管人员视线。
四是建立内部稽核制度。制定了《大姚县财政局国库工作内部控制制度》，加强内部稽核检查，县财政局与人民银行、代理商业银行、各预算单位实行定期对账制度，按规定办理会计档案的立卷、归档、保管、查阅等工作。
五是建立财政资金安全监管制度。按照财政资金监管的要求，县财政局监督检查股负责每月或季度不定期对县、乡两级财政专户进行抽查，直接到开户银行核对银行存款余额，确保银行存款余额与会计账表相符。
